西京医院先后完成世界首例“十指离断再植手术”，全国首创重组合异种骨移植术，全国首例部分活体肝脏移植术，全国首例部分活体小肠移植术、国内首例、世界第5例成人间血型不符活体辅助性肝移植，世界第6例肝胰肾联合移植，世界第2例、国内首例“换脸”术，世界首例异位辅助性活体肝移植等高精尖技术。目前，国家开展的心、肝、肺、肾四项大器官移植项目，西京医院全部获得资格准入。
西京医院现有国家级重点学科9个，博士学位授权学科33个。拥有中国工程院院士1人，“长江学者”7人，国家有突出贡献中青年专家4人，国家杰出青年基金获得者6人，总后科技“三星”人才14人。
第四军医大学西京医院临床免疫科
第四军医大学西京医院临床免疫科，2005年获批准为国家药物临床实验机构组成专业（风湿/免疫）和全军风湿病专科中心。2007年获批准为细胞生物学国家重点学科的骨干学科（免疫细胞生物学）。目前，本学科已成为集医疗、教学、科研和研发于一体的风湿病、免疫/过敏性疾病的诊治、研究和人才培养基地。
学科长期从事风湿病/免疫性疾病的机制及诊断和治疗新途径、新技术的研究，在风湿病、自身免疫疾病的诊断和治疗方面形成了学科的特色。其特色医疗包括：（1）免疫新疗法和新制剂的应用基础和临床研究；（2）炎性关节病的内外科综合诊疗技术；（3）狼疮性肾炎、肺动脉高压、间质性肺纤维化、自身免疫性肝炎等疑难病症的早期诊断、综合治疗；（4）研究并建立健康和疾病时免疫状态的诊断和评估体系。
在2011年复旦大学医院管理研究所公布的2009年度“年度最佳专科排行榜”中，获提名；2012年复旦大学医院管理研究所公布的2010年度“年度最佳专科排行榜”中名列第六。
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