4、仁济医院（西院/黄浦区，东院/浦东新区）——特色专科：风湿免疫科，消化内科
风湿免疫科——仁济医院风湿病学科已成为在国内外具有较大影响的学科。风湿性疾病流行病学调查，包括系统性红斑狼疮、骨关节炎、痛风和COPCORD，填补了国内空白，并开拓性地开展了包括自身抗原抗体、自身免疫风湿性疾病治疗策略以及风湿病相关基因的研究，有力推动了我国风湿病事业的发展。（上海市长宁区光华中西医结合医院的风湿免疫科也是一大特色）
消化内科——为国家重点学科，特色：幽门螺杆菌感染与慢性胃炎、消化性溃疡和胃癌、脂肪肝、消化系肿瘤、病毒性和非病毒性肝炎。（中山医院消化内科其实也不错）
5、长征医院（黄浦区）——特色专科：骨科
骨科——骨科是医院规模最大的科室。以脊柱外科为主干，颈椎外科为特色，关节外科、创伤外科和修复重建外科为重要分支的学科体系。（第六医院骨科侧重关节，长征医院骨科侧重为脊柱）
6、华山医院（静安区）——特色专科：皮肤科，手外科，神经内科，神经外科
皮肤科——在国内外享有较高的声誉和较大的影响，病例数之多、病种之广在国内是首屈一指，在国际上亦属罕见。现有开放病床33张，收治各种疑难杂症和危重病人．并设急诊24小时值班制，皮肤科向社会承诺全年无休，自年初一至年三十，每天都有门诊。为提高医疗质量，配合各研究室、组的科研工作，现开设十多种专病门诊，包括结缔组织病、遗传性皮肤病、化妆品皮炎、银屑病、白癜风、光感性皮肤病、异位性皮炎、真菌病、脱发等。（第一人民医院，中山医院的皮肤科也很好）
手外科——1960年李鸿儒院长决定在骨科中建立手外科组，该科在顾玉东院士带领下，积极开展“急性手外伤及断肢（指）再植”、“拇指与手指再造”、“手部复合损伤之皮瓣修复”、“周围神经损伤之修复”和“臂丛神经损伤之诊治”等多方面临床与研究工作，取得了巨大的成绩。
神经内科——是医院的特色学科之一，教育部重点学科。目前研究重点在以下几个方向：（1）急性脑血管病的规范治疗，一级和二级预防，卒中后康复等方面进行临床基础研究；（2）神经系统自身免疫病，特别是重症肌无力、多发性硬化、格林-巴利和多肌炎等方面进行临床和基础研究；（3）帕金森氏病和老年痴呆等老年神经疾病进行研究；（4）癫痫和偏头痛等发作性疾病的研究。（瑞金医院，长征医院的神经内科也很好）
神经外科——目前主要研究方向微侵袭神经外科、颅底外科、分子神经外科、立体定向放射外科。拥有世界先进水平的神经导航系统、激光刀、伽马刀、细胞刀、超声刀、脑内窥镜、快速磨 钻、手术显微镜，并拥有激光脑血流仪、TCD、颅内压监护仪等。学科带头人科主任、全国政协委员周良辅教授是著名的神经外科专家。
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