小肠细菌过度增长在临床上一般是指小肠菌群失调症。通常情况下，患者可以遵医嘱吃双歧杆菌三联活菌胶囊、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等药物进行治疗。
1.双歧杆菌三联活菌胶囊：该药物是一种微生态制剂，主要成分为嗜酸乳杆菌、粪链球菌、蜡样芽孢杆菌等。其能够调节肠道菌群紊乱的情况，并且还可以促进胃肠道蠕动，从而缓解不适症状。但是不建议孕妇和对本品过敏的人群服用此药。
2.地衣芽孢杆菌活菌胶囊：该药物的主要成分是地衣芽孢杆菌，具有调整肠道菌群的作用，在临床上主要用于治疗与肠道菌群失调相关的急慢性腹泻。如果患者的病情比较严重，则需要及时到医院就诊，并配合医生积极治疗。
除此之外，患者也可以遵医嘱使用乳酸菌素片、布拉氏酵母菌散等药物进行治疗。同时还要注意饮食健康，尽量多吃清淡类的食物，比如新鲜的水果和蔬菜等，避免进食辛辣刺激性的食物，以免加重病情。若期间出现明显不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。
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