生殖器疱疹的潜伏期通常没有2个月，其时间长短不一，一般在1-7天。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛周皮肤黏膜而引起的一种性传播疾病，常表现为簇集或散在的小水疱，破溃后形成糜烂或溃疡。
临床上分为初发性、复发性和亚临床型，其中初发型患者可在感染后的1-5日内出现发热、头痛、颈部淋巴结肿大等症状，在口腔、咽喉、鼻腔黏膜可出现散在红色斑丘疹及浅表溃疡，之后可累及外阴、阴道、龟头、包皮等处，成群小水疱破溃成为大片糜慢，并伴有腹股沟和下腹部淋巴结肿痛以及乏力、低热、纳差等全身症状。而亚临床型感染者无明显临床表现，仅实验室检查发现HSV抗体阳性。至于复发者，则是在原发性或亚急性感染后不进行治疗，经过一段间歇期后又发生与前一次相似的发作。
由于初次感染后，病毒可持续潜伏于神经节内，当机体抵抗力降低时才被激活而发病，因此无法判断具体的潜伏期有多久。但如果是首次感染单纯疱疹病毒导致的生殖器疱疹，通常会在1-3周开始发病；如果是再次感染，则发病的时间可能会相对较早，可能在数小时至48小时内就会发病。
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