鼻甲肥大激光手术的副作用不大。因为是微创手术，创面比较小，术后鼻腔通气恢复比较快，而且术中出血也比较少，一般不会出现大出血的情况。而且术后肿胀反应轻，恢复比较快，也可减少患者的痛苦。此外，因为是在鼻腔内进行手术，一般也不会损伤正常的鼻腔黏膜，可适用于任何鼻甲肥大的患者。但也有可能出现术后感染、鼻腔黏膜损伤、鼻腔干燥、嗅觉减退等副作用。
1、术后感染：鼻甲肥大激光手术后，可能会出现感染。因为激光手术对鼻腔黏膜的刺激，会使得黏膜抵抗力降低，而且术后换药不及时，也可能会使得细菌或病毒入侵引起感染;
2、鼻腔黏膜损伤：鼻甲肥大激光手术中，因为对鼻腔黏膜的损伤，可能会使得术后鼻腔黏膜出血。如果术中止血不彻底，术后可能会出现鼻腔黏膜糜烂、鼻腔黏膜干燥，甚至继发萎缩性鼻炎等情况;
3、鼻腔干燥：鼻甲肥大激光手术中，如果对鼻腔黏膜的损伤过大，术后可能会出现鼻腔干燥。而且鼻甲黏膜腺体的分泌功能并没有完全消失，可能会出现术后鼻腔干燥，甚至会继发出血;
4、嗅觉减退：部分患者可能在术后一段时间，或是几个月后，出现嗅觉减退或丧失;
5、瘢痕：如果患者为瘢痕体质，容易在术后形成瘢痕增生。
此外，如果患者对光比较敏感，或为过敏性体质，可能在术后发生局部水肿，甚至水泡的形成，应及时就诊，进行消肿或抗过敏治疗。
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