尿分叉是由于前尿道或尿道开口处暂临时有部分梗阻所引起的，或带有某种疾病等所导致。以下为尿分叉的可能原因。
1.泌尿生殖系统可能存在某些疾病，如尿道炎、前列腺炎等。这类疾病除了有尿分叉，常伴有尿频、尿急、尿痛等症状，致病原因通常有细菌、衣原体、支原体、滴虫、霉菌等。在病原微生物的侵害作用下，受累的组织器官发生炎症，尿道黏膜渗出物或前列腺分泌物增多，分泌物中含有粘蛋白成分，尿分叉当分泌物流至尿道外口后水分被蒸发，粘蛋白使尿道外口粘连闭合。排尿时闭合的尿道外口在尿液的冲击作用下如果仅有部分开放，会表现为尿线变细，闭合的尿道外口呈筛格状开放时，尿线便分叉了，到尿道外口完全开放时，尿分叉尿线又恢复了正常。
2.发生性激动或过性生活后，有时也会出现尿线分叉。尿分叉前者因性激动使生殖器充血，导致尿道内腺体分泌液增多，而后者则是剩余在尿道内精液流出，作用机能与炎症时大致相同。
3.在医学上一般把尿分叉的原因归纳为两大类。偶发性或一时性尿分叉（生理性尿分叉）和经常性或长期性尿分叉（病理性尿分叉）。生理性尿分叉是偶发或一时性的，这大多与疾病无关。其主要是由于前尿道或尿道开口处临时有阻塞。病理性尿分叉因为经常的或长期的排尿分叉，有很大的可能与一些自身疾病相关。长期排尿分叉大多由于后尿道或尿道口处狭窄，或因慢性炎症后形成瘢痕，导致了尿液不能通畅排出。急性尿道炎、前列腺炎，由于尿道充血、肿胀、分泌物增多，可影响尿液的通畅而出现分叉现象。
4.并不是说所有的尿分叉都是因为自身存在的疾病引起，也很有可能是自己过于焦虑，激动，烦心从而引起的尿分叉，自己吓自己。
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