口腔溃疡变成深坑时，一般不需要进行特殊治疗，等待其自然愈合即可。如果存在其他伴随症状，如疼痛、红肿等，可以通过使用药物、激光治疗、补充维生素及微量元素等方式来缓解症状。
1、使用药物：口腔溃疡变成深坑一般是表皮细胞受到损伤，形成水疱导致，可以局部使用口腔溃疡散、甲硝唑口腔粘贴片等药物，涂抹在口腔溃疡表面，可以促进口腔溃疡愈合，缓解口腔溃疡变成深坑的情况;
2、激光治疗：如果由于口腔咬合创伤而造成口腔溃疡，且口腔溃疡面积较大，在变成深坑后，可能会出现不易愈合的现象。此时可以通过激光治疗的方式，来缓解口腔溃疡变成深坑的情况，如脉冲染料激光;
3、补充维生素：口腔溃疡变成深坑时，可能是缺乏维生素导致，此时可以通过食用维生素含量高的食物，如菠菜、芹菜、苹果、梨等，补充机体缺失的维生素，可以使口腔黏膜恢复正常，继而缓解口腔溃疡变成深坑的情况;
4、微量元素：如果患者存在微量元素缺乏的情况，也可能会导致口腔溃疡变成深坑。此时可以通过使用葡萄糖酸锌、葡萄糖酸铜等药物，缓解口腔溃疡变成深坑的情况。
在日常生活中，出现口腔溃疡变成深坑的情况时，需要注意保持口腔卫生，饭后及时漱口，使用改良巴氏刷牙法刷牙，防止食物残渣堆积而滋生细菌，同时需要注意清淡饮食，避免摄入辛辣、油腻等刺激性食物，以免刺激口腔溃疡。
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