治口腔溃疡的药物种类较多，主要包括局部消炎药物、促进愈合药物、免疫抑制药物、抗生素等。如果吃掉治口腔溃疡的药，对于疾病本身并无较大影响，但由于口腔溃疡本身会有疼痛感，可能会影响食欲而导致营养摄入不足，若此时存在其他疾病，如胃炎、胃溃疡等，则会加重症状，此时可遵医嘱针对不同疾病，进行治疗。
1、局部消炎药物：如复方氯己定含漱液、呋喃西林溶液等，主要是用于治疗口腔溃疡，通过其消炎的作用，促进溃疡面的愈合;
2、促进愈合药物：如西瓜霜、冰硼散、重组人表皮生长因子凝胶等，此类药物具有促进口腔上皮细胞生长、加速溃疡愈合的作用;
3、免疫抑制药物：如泼尼松、甲泼尼龙等，需在医生指导下服用，主要是为了避免溃疡复发，对于减轻疼痛、促进溃疡愈合有一定作用;
4、抗生素：如果口腔溃疡合并有细菌感染，如白喉杆菌等，则需服用抗生素，包括阿莫西林、青霉素等。
此外，对于部分中成药，也可用于治疗口腔溃疡，如地黄饮子、养阴生肌散等，可起到养阴生肌、补中益气的作用，但需注意在医生指导下服用，且糖尿病患者需慎用。上述药物对于口腔溃疡的治疗，仅能起到辅助作用，并不能根治口腔溃疡。建议在日常生活中，注意口腔卫生，早晚正确刷牙，饭后可用清水或淡盐水漱口，多吃富含维生素的新鲜蔬菜、水果，避免食用辛辣、刺激、过热、过硬的食物。
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