(1) 选择敏感抗生素：在应用抗生素治疗之前，应当先留取标本行尿常规和细菌培养和药敏检查，有条件的病人应当做膀胱穿刺尿培养。如果病情需要，可先经验性使用抗生素，再根据细菌培养和药敏试验结果选择敏感的抗生素。
(2) 抗生素治疗要有足够的剂量和疗程：根据患者的肝、肾功能状态给予足够剂量，疗程至少10~14 天，治疗后停药一周需再行中段尿培养以明确细菌是否清除，必要时再延长用药时间。反复发作的患者，在急性期后可选用2~4组不同种类抗生素交替使用，治疗2~4个月。无效或仍再发的患者可采用长期抑菌治疗。
(3) 妊娠期尿路感染宜选用毒性较小的抗菌药物，如阿莫西林、呋喃妥因或头孢菌素类等。四环素类、氯霉素、喹诺酮类不宜用，复方磺胺甲噁唑、氨基糖苷类慎用。孕妇的急性膀胱炎应使用抗菌药物7天，治疗后要复查以确证治愈;以后，每个月要作尿细菌培养，直至分娩。孕妇急性肾盂肾炎应静脉滴注抗生素治疗。在妊娠中反复发生尿路感染者，可用呋喃妥因作长疗程低剂量抑菌疗法。
(4) 久治不愈或反复发作的患者，应做尿路影像学检查，以弄清有无尿路结石、肿瘤、异物、梗阻、解剖异常和膀胱输尿管反流等情况，还应注意有无糖尿病、免疫缺陷等全身性慢性疾病。
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