眼角膜移植手术可能会出现排斥反应、继发性青光眼、缝线松散、感染、缝线帽松动、角膜内皮移植术失败等后遗症。建议患者在进行眼角膜移植手术前，应充分了解手术的风险及后遗症，在医生的指导下进行选择。
1、排斥反应：如果角膜移植手术是从异体角膜移植入到患者眼内，就可能会发生排斥反应，机体会对移植的角膜进行攻击，可导致局部组织出现炎症反应，并出现充血、水肿等症状;
2、继发性青光眼：角膜内皮移植手术时，可能会导致眼内的渗透压发生变化，使房水变得黏稠，如果患者自身的眼压较高，就会使虹膜膨胀，前房角狭窄，导致房水排出不畅，使眼内压力升高，从而诱发继发性青光眼;
3、缝线松散：如果进行角膜移植手术缝合时，缝合不紧密，就可能会造成缝线松散的情况，进而影响伤口愈合，甚至还可能会导致缝线脱落;
4、感染：如果角膜移植手术后护理不当，就可能会导致细菌、病毒等病原微生物在局部繁殖，导致局部出现炎症反应，并出现充血、水肿、渗出等症状;
5、缝线帽松动：如果进行角膜移植手术时，缝合后缝线帽过于松动，就可能会导致缝线帽在患者眼睛里面滑动，从而引起缝线帽松动的情况;
6、角膜内皮移植术失败：角膜内皮移植手术是指将供体的角膜内皮经特殊处理后，移植到患者体内，从而使角膜得到修复的一种手术。如果在进行角膜内皮移植手术时，缝合不紧密，或缝合不牢密，就可能会导致角膜内皮移植术失败。
患者在进行角膜移植手术后，应注意卧床休息，尽量不要下床活动，以免发生体位改变而导致手术失败，同时应注意切口部位的清洁，不要沾水，避免发生感染。
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