多重耐药菌是否会终身存在，需要根据具体情况判断。如果患者经过积极治疗后病情好转，则可能不会出现终身的情况，但如果患者没有积极配合医生进行治疗，则可能会终身存在。
1.可能不会：若感染多重耐药菌的患者，在医生指导下使用注射用头孢他啶、盐酸环丙沙星片等药物进行抗感染治疗，并注意保持良好的生活习惯，如戒烟酒、避免熬夜等，通常可以抑制体内的多重耐药菌生长和繁殖，从而达到治愈疾病的目的。此时则可能不会导致该病持续存在。
2.可能会：但如果患者在患病期间仍然不配合医生进行针对性治疗，或者未做到饮食护理以及生活管理等，就容易使多重耐药菌大量增殖而引起严重后果。此外，由于长期吸烟喝酒或作息时间紊乱等因素也会影响身体免疫力下降，从而使多重耐药菌反复侵袭机体，进而可导致该病长期存在。
因此建议患者及时明确自身情况，在专业医生指导下选择合适的处理方式，以免加重不适症状。
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