部分乙型肝炎患者待肝功能恢复正常后，血液中仍有HBsAg持续阳性而成为HBsAg携带者，还有少数人可向慢性肝炎发展，并最终发展为肝炎后肝硬化、肝癌等，可谓肝炎后遗症。丙肝病毒感染后，慢性化率较高，而且大约有20%～30%发展成肝硬化，并有可能在此基础上再发展成肝癌。但发展为肝硬化、肝癌的时间较长，分别大约需要20年和30年。丁肝病毒感染后，会使一部分乙型肝炎病人发展为重型肝炎和肝硬化。甲型和戊型肝炎一般不产生后遗症。尽管部分甲型肝炎恢复较久往往可超过6个月（称慢性化趋势），但随访仍无后遗症发生。中国肝病防治中心温馨提示：急性肝炎一般预后较好，在治疗的同时要注意保养通常是不会有后遗症的。
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