鼻通喷剂可能存在轻微的副作用，但通常不会对大多数人产生严重的影响。
鼻通喷剂中的主要成分为抗组胺药或皮质类固醇，这些物质能有效抑制过敏反应及减少黏膜充血，从而达到快速止痒、止涕的效果；但长时间高浓度使用会导致局部皮肤萎缩或其他相关并发症。因此，在使用过程中应注意剂量与频率以降低副作用发生率。
长期、过量使用可能引起药物性鼻炎，导致鼻塞加重。
在使用鼻通喷剂时需遵循医嘱，避免滥用，特别是对于患有高血压、糖尿病等基础疾病者以及儿童、老年人群，以免出现不良后果。
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