卵泡萎缩孕酮是否会增高，需要根据具体情况进行判断。导致卵泡萎缩的原因较多，如果是生理性萎缩，通常孕酮会增高，如果是病理性萎缩，如先兆流产、黄体功能不全等，此时孕酮可能不会增高。
一、生理性萎缩：
女性在月经周期的中间会出现排卵现象，排卵以后卵巢表面会形成黄体，黄体会分泌大量的孕激素，在高孕激素的作用下，就会使子宫内膜转化，进而出现增厚现象。随着黄体的萎缩，孕酮水平会出现下降，这种情况下卵泡萎缩孕酮一般会增高。
二、病理性萎缩：
1、先兆流产：女性在怀孕以后，如果体内孕酮水平不足，或者受到外界因素的影响，比如外伤、情绪激动等，可能会发生先兆流产，从而导致子宫内膜出现损伤，而在黄体形成以后，孕酮的水平会明显下降，导致卵泡萎缩孕酮可能不会增高;
2、黄体功能不全：如果女性存在黄体功能不全，体内的孕激素不能维持子宫内膜的状态，子宫内膜可能会发生少量剥脱，从而出现卵泡萎缩孕酮不升高的情况;
3、其他原因：比如雄激素水平增高、泌乳素增高、甲状腺功能紊乱等，也会导致卵泡萎缩孕酮不会增高，因为以上因素会导致体内激素分泌紊乱，从而影响卵泡的发育以及成熟。
如果出现卵泡萎缩的情况，建议及时到医院就诊，根据不同的病因进行治疗。如果是先天性卵巢发育不全导致的卵泡萎缩，通常可以遵医嘱应用戊酸雌二醇片等进行治疗。
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