绝经后巧克力卵巢囊肿可能自行消失，但需根据个体情况决定是否需要治疗。
巧克力囊肿，又称子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜组织在卵巢外生长形成的囊肿，因其内容物呈深棕色，类似巧克力，故得名。这种囊肿的特点是随着月经周期变化，囊内出血并积聚，导致疼痛和囊肿增大。绝经后，女性激素水平显著下降，特别是雌激素的减少会抑制子宫内膜的生长。因此，在理论上，绝经后由于缺乏雌激素的支持，巧克力囊肿可能会逐渐缩小甚至消失。然而，每个人的身体反应不同，有的患者可能需要进一步的治疗。处理建议包括观察（如果症状轻微或无症状）、药物治疗（如使用口服避孕药以调节激素水平）或手术干预（如腹腔镜手术移除囊肿）。最终是否需要治疗以及选择何种方式，应由医生根据患者的具体情况来决定。
患者在关注巧克力卵巢囊肿的同时，保持规律的生活作息和良好的心态对健康也十分重要。定期体检以及与医生保持沟通是管理疾病的关键。