肩胛骨两侧疼痛可能是由肩周炎、肌筋膜炎、颈椎病、肩关节结核、类风湿关节炎等疾病引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。
1.肩周炎
肩周炎是由于肩关节周围软组织发生退行性变、慢性劳损等原因导致的炎症。炎症刺激会导致局部肌肉和韧带紧张、痉挛，从而引起疼痛。患者可遵医嘱使用非甾体抗炎药进行止痛治疗，如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等。
2.肌筋膜炎
肌筋膜炎是指由寒冷、潮湿、慢性劳损等因素引起的肌肉和筋膜的无菌性炎症反应，当炎症因子刺激时会引起肩部酸胀、疼痛等症状。患者可在医生指导下通过热敷的方式缓解不适症状，比如用热水袋或者暖宝宝隔着衣服放在肩部的位置。
3.颈椎病
颈椎病是由颈椎长期劳损、椎间盘突出等原因所致，突出的椎间盘压迫神经根，可能会出现肩背部放射性疼痛的症状。对于轻度的颈椎病，可通过牵引疗法来改善病情，但需要在专业医师的操作下进行。
4.肩关节结核
肩关节结核是由结核分枝杆菌感染引起的，结核分枝杆菌会对肩关节造成破坏，导致肩关节僵硬和疼痛。患者应遵照医嘱接受足量足疗程的抗结核药物治疗，例如异烟肼、利福平等。
5.类风湿关节炎
类风湿关节炎是一种以免疫系统攻击自身关节为主要特征的疾病，炎症活动期会出现肩关节肿胀、疼痛的情况。患者应在医生指导下服用非甾体抗炎药控制病情，常用药物包括塞来昔布、美洛昔康等。
针对肩胛骨两侧疼痛的情况，建议患者及时就医并完善相关影像学检查，如X光片或MRI扫描，以排除骨折或其他结构性损伤的可能性。同时，注意休息，避免剧烈运动，以免加重疼痛。