嘴巴上长小水泡可能是上火、单纯疱疹、脂溢性皮炎、唇炎、过敏性皮肤病等原因所引起的，患者可在医生的指导下根据不同病因选择合适的药物进行治疗。
1、上火
如果患者经常吃辛辣刺激性的食物，可能会导致体内的火气过于旺盛，从而出现嘴巴上长水泡的情况，还可能会伴有口舌生疮、咽喉肿痛等症状。患者可以在医生的指导下使用牛黄上清丸、黄连上清片等药物进行治疗，同时还要注意多喝水。
2、单纯疱疹
单纯疱疹是由于机体感染单纯疱疹病毒引起的一种皮肤病，常表现为嘴巴上长水泡，同时还会伴有疼痛、瘙痒等症状。患者可以在医生的指导下使用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等药物进行治疗，也可以遵医嘱外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏等药物进行治疗。
3、脂溢性皮炎
脂溢性皮炎是一种比较常见的皮肤病，常发生于头皮、面部，主要表现为皮肤出现红斑、油腻性脱屑等，可能会出现嘴巴上长水泡的情况。患者可以在医生的指导下使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏等药物进行治疗，也可以遵医嘱服用伊曲康唑胶囊、盐酸特比萘芬片等药物进行治疗。
4、唇炎
唇炎是发生在唇部的炎症性疾病的总称，病因尚不明确，有多种不同因素，主要与一些长时间的慢性刺激性反应有关，如慢性唇炎、日光性唇炎、脱屑性唇炎等。患者可出现嘴巴上长水泡、肿胀、糜烂、脱屑等症状。患者可在医生的指导下使用曲安奈德益康唑乳膏、罗红霉素胶囊等药物进行治疗。
5、过敏性皮肤病
过敏性皮肤病是指过敏原通过皮肤或黏膜接触、吸入、注射及食入等途径进入机体后，所引起的异常免疫反应。如果患者食用易过敏的食物，如海鲜、芒果等，或者接触到花粉、尘螨等过敏原，可能会引起过敏性皮肤病，从而导致嘴巴上长水泡的情况，同时还可能会伴有皮肤瘙痒、红肿等症状。患者可以在医生的指导下使用氯雷他定片、盐酸西替利嗪片等药物进行治疗，也可以遵医嘱外用炉甘石洗剂、地奈德乳膏等药物进行治疗。
建议患者及时去医院就诊，明确病因后再进行治疗。