通常情况下，补脾益肠丸和金匮肾气丸可以一起吃，但是建议间隔半小时后再服用，可提高药物的疗效、减少胃肠道的负担。
补脾益肠丸主要成分包括黄芪、白术、党参、砂仁等，具有益气健脾、和胃止泻的功效，临床上主要用于治疗脾虚泄泻症引起的腹痛、腹泻、肠鸣等症状。金匮肾气丸的主要成分包括地黄、山药、茯苓等，具有温补肾阳、化气行水的功效，临床上主要用于治疗肾虚水肿、腰膝酸软、小便不利等症状。补脾益肠丸和金匮肾气丸都是常用的中成药，两者之间并没有配伍禁忌，一般可以一起服用，但是建议间隔半小时后再服用，可提高药物的疗效、减少胃肠道的负担，有利于疾病的恢复。
需要注意的是，上述药物均需在医师辩证指导下使用，不可盲目自行服用，以免引起不良后果。另外，服用上述药物时，建议清淡饮食、多饮水，避免进食辛辣刺激食物，以免影响药物疗效。