有褐色分泌物时，是否可以进行妇科检查需视具体情况而定。
褐色分泌物可能是由于生理原因或疾病导致的，如排卵期出血、宫颈炎或子宫内膜异位症等。如果分泌物量少且没有其他症状，通常可以进行妇科检查以评估是否存在相关疾病。但如果分泌物量多或伴有其他症状，如瘙痒、异味等，可能表明存在感染或其他严重问题，此时不应进行妇科检查，应立即就医寻求专业医疗帮助。
若出现大量褐色分泌物伴随剧烈腹痛等症状，则可能存在宫外孕的风险，此时不宜进行常规妇科检查，以免加重病情。
建议在发现异常分泌物后及时咨询医生，并遵循医嘱决定是否进行妇科检查。同时注意保持良好的个人卫生习惯，避免性生活过度频繁，以减少不必要的风险。