亚甲基蓝有毒性，高浓度刺激皮肤、眼睛和呼吸系统，可能影响肝脏和肾脏，操作时需防护。
亚甲基蓝，化学名称为次甲基蓝或次甲蓝，是一种蓝色的有机化合物，化学式为C16H18N3Na3O9S，常用于生物染色、纺织品染色和水处理等领域。作为生物染色剂，它被用于细胞或组织的显微观察。亚甲基蓝的毒性主要源于其化学结构中的硫代硫酸根和氮原子，这些部分可能对人体产生刺激性和潜在的毒性。在高浓度下，亚甲基蓝可能对皮肤、眼睛和呼吸系统产生刺激。动物实验表明，亚甲基蓝口服后可能会引起肠胃道反应如恶心、呕吐和腹泻。长期或高剂量暴露还可能对肝脏和肾脏功能产生影响。然而，在正常实验和应用条件下，如细胞染色或纺织品处理中使用适当浓度，并采取必要的防护措施，其毒性风险通常是可以控制的。尽管如此，对于敏感人群或者在未受监管的环境中使用时，仍需谨慎对待亚甲基蓝。例如，在实验室操作中应佩戴防护眼镜和手套，并确保良好的通风条件。在纺织品染色过程中，工人应遵守安全操作规程，并避免直接接触皮肤。
对于一般公众而言，无需过度担忧日常生活中可能接触到的亚甲基蓝（如某些衣物染料）。但对于特殊职业群体如实验室人员或纺织工人，则需要定期进行健康检查以监测可能的职业暴露影响，并遵循制造商提供的安全指南。