酮康唑和复方酮康唑的区别在于酮康唑是属于抗真菌药物，而复方酮康唑是属于抗真菌药物，酮康唑包含复方酮康唑。
酮康唑是属于咪唑类抗真菌药物，能够抑制真菌细胞膜的合成，从而达到抑制和杀灭真菌的作用，在临床上主要用于治疗皮肤浅表真菌感染，比如手癣、足癣、体癣等。复方酮康唑是属于复方制剂，是由酮康唑和丙酸氯倍他索组成，其中酮康唑是属于咪唑类抗真菌药物，复方酮康唑是属于丙酸氯倍他索类抗真菌药物，两者的区别主要在于酮康唑是属于抗真菌药物，而复方酮康唑是属于抗真菌药物。
除此之外，这两种药物的区别也在于适应证、不良反应等方面。患者在用药时需要严格遵医嘱进行，避免自行盲目用药。