一般而言，较小的良性囊肿且无症状时通常不需要手术；而较大的囊肿、有恶变风险或引起严重症状的囊肿则往往需要手术干预。
- 对于一些较小的功能性囊肿，如卵巢滤泡囊肿、黄体囊肿等，其多是由于女性生理周期中激素水平波动而形成的，通常在几个月内可自行消失，一般不需要手术。这类囊肿直径常小于5厘米，患者大多没有明显的不适症状，只是在妇科检查或超声检查时偶然发现。此时只要定期复查超声，监测囊肿大小变化即可，通常无需进行手术治疗。
- 然而，当妇科囊肿较大，直径超过5厘米时，容易发生扭转、破裂等并发症，引发急腹症，如剧烈腹痛、恶心、呕吐等，这种情况下需要手术切除囊肿以避免更严重的后果。其次，若囊肿持续存在或有增大趋势，即使是良性囊肿，也可能对周围组织器官产生压迫，影响其功能，比如压迫输尿管导致肾积水，此时也需手术解除压迫。再者，对于一些影像学检查提示囊肿有恶变可能，如囊肿边界不清、内部回声不均匀、有实性成分或伴有血供丰富等情况，必须尽快手术，术后还需进行病理检查，以确定是否为恶性肿瘤，并根据结果决定进一步的手术范围和后续治疗方案。
对于妇科囊肿患者，日常要注意保持良好的生活习惯，规律作息，避免过度劳累和精神紧张。若需要手术治疗，如囊肿切除术，患者应积极配合医生完善术前准备，术后注意休息，按照医生要求进行护理，预防感染，促进身体恢复。同时，术后仍需定期复查，以便及时发现可能的复发情况。