通常情况，并没有木糖醇和赤藓糖醇哪个更安全的说法。如果对两者均不存在过敏反应，可以根据自身需要进行选择。
木糖醇属于一类糖醇，可以为人体补充一定的糖分，从而避免出现血糖水平过低现象。而赤藓糖醇对于人体血糖水平会产生影响，可以辅助改善血糖水平过低造成的影响。因此，两者均属于比较安全的食品添加剂，可以根据自身需要进行选择。
如果对木糖醇或赤藓糖醇中的成分有过敏反应现象，不建议食用，以免出现自身机体损伤。如果过量食用木糖醇，可能会造成胃肠道黏膜组织受损，从而引发腹痛、腹胀、恶心、呕吐等症状。如果食用赤藓糖醇后，出现消化不良，可以在饭后适当进行散步，辅助改善以上症状。