孩子手指脱皮，指甲凹凸不平多考虑是缺乏微量元素、湿疹、手癣等原因引起的，可以根据不同的原因选择针对性的治疗。
1、缺乏微量元素
如果孩子平时比较挑食，可能会导致身体缺乏微量元素，从而引起指甲营养不良，出现指甲表面不平整、指甲凹凸不平等症状。可以在医生指导下使用复合维生素片（适用于14岁及以上的儿童和成人，14岁以下禁用）、硫酸亚铁片等药物辅助改善，平时也可以多吃一些新鲜的水果蔬菜，例如苹果、生菜等。
2、湿疹
不良饮食习惯、接触化学制品等原因可能会引起该疾病，导致出现丘疹、丘疱疹等症状，并且可能会伴随指甲凹凸不平的症状。可以遵医嘱使用糠酸莫米松乳膏、卤米松乳膏等药物辅助改善，平时要保持居住环境的清洁卫生，并且要保持居住环境的温度和湿度适宜。
3、手癣
如果手指部位长期处于湿润的状态下，可能会引起手癣，导致出现脱屑、水疱等症状，并且可能会伴随指甲增厚、粗糙等症状。可以遵医嘱使用克霉唑乳膏、盐酸特比萘芬乳膏等药物辅助改善，平时要注意保持手部的清洁干燥，不要长时间浸泡在水中。
除此之外，也有可能是剥脱性角质松解症等原因引起的，需要及时到医院通过检查明确病因，然后在医生指导下做针对性的治疗。