克霉唑软膏能够治疗真菌感染引起的龟头炎，但对于细菌及其他非感染因素引起的龟头炎症无效。
克霉唑软膏能够抑制真菌细胞膜的合成，治疗真菌感染引起的阴道炎、龟头炎、念珠菌性甲沟炎等，对于细菌等其他病原体感染没有抑制的作用。真菌性的龟头炎外用克霉唑软膏能够缓解瘙痒，减少炎性分泌物，缩短病程。克霉唑软膏使用后有可能会引起刺激症状，如瘙痒、红斑、水肿，要停止用药，及时地清洗干净；对于其过敏者禁用药物。龟头炎除了真菌感染，还可能是细菌性感染、物理性刺激、过敏等原因引起的，此时用克霉唑软膏治疗无效。
龟头发炎一般指龟头炎。最好的治疗方法不能一概而论，要根据病因进行针对性治疗。例如：如果是白色念珠菌感染引起的龟头炎，医生一般会给患者外用克霉唑乳膏、硝酸咪康唑乳膏等药物治疗；当外用药物效果不明显或症状严重时，医生还会给患者口服氟康唑片、伊曲康唑胶囊等药物，以提高治疗效果。如果是需氧菌感染引起的龟头炎，医生一般会给患者外用倍他米松乳膏等药物治疗；病情严重时，医生会给患者口服红霉素片、阿莫西林、克拉维酸钾分散片等药物，以提高治疗效果。如果是阴道毛滴虫感染引起的龟头炎，医生一般会给患者口服甲硝唑片等药物，快速缓解患者的不适。如果是由于非感染性因素所导致的龟头炎，则在无渗出皮损时，医生会为患者外用中弱效的糖皮质激素霜剂或乳膏等进行治疗。