通常情况下，无法比较曲古霉素还是伊曲康唑哪个好，二者的适应症不同，患者应根据具体病情遵医嘱选择合适的药物。
1、曲古霉素
曲古霉素是一种多烯类抗真菌药物，能与真菌细胞膜上的甾醇结合，损伤真菌细胞膜的通透性，导致细胞内的重要物质如钾离子、核苷酸和氨基酸等外漏，破坏真菌细胞的正常代谢从而起到抗真菌的作用。临床上主要用于治疗敏感菌引起的炎症、真菌感染、血液系统疾病、恶性肿瘤等。
2、伊曲康唑
伊曲康唑是一种三唑类抗真菌药物，可通过干扰真菌细胞膜麦角甾醇的合成，影响真菌的脂质代谢，使真菌细胞膜的通透性增加，从而发挥抗真菌的作用。临床上主要用于治疗皮肤真菌、酵母菌、真菌性角膜炎、甲真菌病、系统性真菌感染等。
3、两性霉素B
两性霉素B是多烯类抗真菌药物，具有广谱抗真菌作用，对多种真菌尤其是深部真菌有较好的抗菌活性，对新型隐球菌、念珠菌属等也有一定的抗菌活性，对曲霉菌属、毛霉菌属等其他丝状真菌也具有一定的抗菌活性。临床上主要用于治疗敏感菌引起的肺部、腹腔和胸腔的感染，也可用于治疗阴道、食道念珠菌病，还可用于脑膜、脑炎的治疗。
4、氟康唑
氟康唑是一种广谱抗真菌药物，可通过干扰真菌细胞色素P-450的活性，从而抑制真菌细胞膜上麦角固醇的生物合成，影响真菌的脂质代谢，使真菌细胞膜的通透性增加，以致重要物质外漏，从而起到抗真菌的作用。临床上主要用于治疗念珠菌感染、隐球菌感染、球孢子菌病、侵袭性念珠菌病、芽生菌病等。
5、伊曲康唑
伊曲康唑是一种三唑类抗真菌药物，可通过干扰真菌细胞膜上麦角甾醇的合成，影响真菌的脂质代谢，使真菌细胞膜的通透性增加，以致重要物质外漏，从而起到抗真菌的作用。临床上主要用于治疗皮肤真菌、酵母菌、真菌性角膜炎、甲真菌病、系统性真菌感染等。
建议患者在医生的指导下选择药物，不可盲目用药，以免出现不良反应。
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