肚子疼一般指的是腹痛，用跑步方式锻炼，第二天腹痛可能是正常的，也有可能是消化不良、肠痉挛等原因引起的，需要根据病因采取针对性的治疗措施。
1、正常
如果平时不注意休息，长时间进行剧烈的运动，可能会导致腹部的肌肉过度劳损，第二天可能会出现腹部疼痛的症状。这属于正常的，一般不需要过于担心，也不需要进行特殊的治疗，适当地休息后能够有所缓解。
2、消化不良
如果平时不注意饮食，吃了难以消化的食物，可能会导致消化道的负担过重，容易出现腹部胀气、疼痛的症状。可以遵医嘱使用健胃消食片、双歧杆菌三联活菌散等药物进行治疗，从而使疾病得到改善，也可以适当地按摩腹部。
3、肠痉挛
考虑跟不正确的运动方式有关，可能会导致肠道胀气，甚至会伴随疼痛的症状。可以适当地进行热敷，也可以遵医嘱使用多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等药物进行治疗。
除此之外，也不排除是急性胃肠炎、慢性胃炎等原因引起的，需要及时就诊。
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