头孢克肟和头孢噻肟都属于第三代头孢菌素，是临床上常用的抗生素，两者的区别在于抗菌谱不同、适应证不同、禁忌证不同等。
1、抗菌谱不同
第三代头孢菌素对革兰氏阳性菌的抗菌效果强于第二代和第四代，对革兰氏阴性菌的作用较弱。但对革兰氏阴性菌的作用比第三代头孢更强。头孢噻肟钠对革兰氏阴性菌、部分厌氧菌有很强的抗菌作用，其作用机制与头孢克肟相似。
2、适应证不同
第三代头孢菌素对革兰氏阳性菌的抗菌谱更广，如肺炎链球菌、肠球菌、大肠杆菌、沙雷氏菌属、枸橼酸杆菌属等。对于大多数的革兰氏阴性菌，如伤寒沙门菌、副伤寒沙门氏菌、大肠杆菌属、枸橼酸杆菌属、克雷伯氏菌属等都有很好的抗菌活性。头孢噻肟钠对大多数革兰氏阳性菌、部分厌氧菌及部分肠杆菌属细菌有很好的作用。
3、禁忌证不同
第三代头孢菌素不能用于皮肤软组织、骨骼和腹腔等的穿透，避免造成广泛的组织损伤;第三代头孢菌素与其他头孢菌素类似，会引起严重的过敏反应，因此在用药前必须做好过敏试验，一旦发生过敏反应，应及时停药，并针对过敏反应进行治疗。头孢噻肟钠不能用于有青霉素过敏史或青霉素皮试阳性的患者，也不能用于胃肠道疾病，有胃肠道疾病的患者需要在饭后服用，以减少药物对胃肠道的刺激。
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