颅底凹陷症是先天性的。
颅底凹陷症是由胚胎发育过程中颅底结构未能正常形成或发育不全所引起的。这种畸形通常在出生时就已经存在，可能与遗传、环境等多种因素有关。
颅底凹陷症还可能是由于外伤导致的后天性损伤所致。此时，患者可能出现头痛、眩晕等症状，严重者可伴有肢体无力、行走不稳等表现。
对于先天性颅底凹陷症，应密切监测病情变化，避免剧烈运动以减少脊髓受压风险；对于后天性颅底凹陷症，则需尽早治疗，防止进一步神经功能损害。
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