HPV39高危阳性一般是指人乳头瘤病毒39型阳性，通常临床上并不存在人乳头瘤病毒39型阳性怎么治疗最好的说法。患者可以通过日常调理、药物治疗、物理治疗等方式进行改善，有利于病情的恢复。
1、日常调理
人乳头瘤病毒39型阳性说明体内感染了人乳头瘤病毒，是一种传染性疾病，主要通过性接触传播、间接接触传播、母婴传播等途径传染。如果患者检查结果为阳性，但身体没有出现明显的不适症状，可以通过自身的免疫力自愈。建议患者在平时要注意个人卫生，避免不洁的性生活，勤换洗内裤，对自己的个人物品定期消毒。
2、药物治疗
如果患者出现了明显的不适症状，也可以在医生的指导下使用氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，也可以遵医嘱口服阿昔洛韦胶囊、盐酸伐昔洛韦胶囊等药物进行治疗。
3、物理治疗
如果病情比较严重，患者也可以及时到正规医院的皮肤科，积极配合医生通过液氮冷冻、激光等方式进行辅助治疗。
除此之外，也可以通过手术治疗的方式进行改善，能够达到治疗的目的。
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