怀孕一般是指妊娠，月经一般是指月经。用标准的妇科检查仪器查出宫内妊娠但肚子隐隐作痛，可能是生理性原因引起的，也可能是先兆流产、宫外孕等原因引起的，可以根据病因进行针对性治疗。
1、生理性原因
月经周期比较规律的女性，在排卵期进行性生活时，可能会出现妊娠的情况，此时可能会伴随着下腹部隐隐作痛的症状。这是一种正常的生理现象，一般不需要进行特殊治疗，但是要注意多休息，避免进行剧烈运动。
2、先兆流产
如果女性在妊娠期间，不注意自身的护理，容易诱发先兆流产的情况，此时会出现阴道少量出血、下腹部疼痛等症状。可以在医生的指导下服用地屈孕酮片、黄体酮胶囊等药物进行治疗，同时还要注意多休息，避免进行剧烈运动。
3、宫外孕
通常是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，患者可能会出现下腹部疼痛、阴道流血等症状，严重时还可能会出现晕厥、休克等现象。患者可以通过手术终止妊娠，术后还要注意多休息，短时间内避免进行剧烈运动，以免影响身体恢复。
除了上述原因以外，还可能与子宫肌瘤、卵巢囊肿等原因有关，建议及时到正规医院进行检查并治疗，以免延误病情。
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