真菌性角膜炎一般是药物治疗首选局部或全身应用抗真菌药，病情仍不能控制的考虑手术治疗。
对于真菌性角膜炎的治疗，可局部使用抗真菌药物，如多烯类、唑类、嘧啶类等。如果病情严重，可以添加其他给药方法，可在静脉滴注抗真菌药物。注意观察药物的疗效。一般来说，药物起效的迹象包括疼痛减轻、浸润范围缩小和溃疡边缘变钝。如果没有改善，则改变治疗模式并增加剂量。真菌性角膜炎常合并虹膜睫状体炎。在这种情况下，阿托品滴眼液或眼霜应用于散瞳，而不是糖皮质激素。对于一些治疗后病情仍无法控制的患者，此时可以考虑手术治疗，主要是清创、结膜瓣覆盖和角膜移植。具体情况取决于具体情况。早期清创可使药物进入角膜基质，提高病灶内药物浓度，清除病原菌。
建议患者平时注意避免吃辛辣的油腻的饮食，多喝水多吃蔬菜水果，避免熬夜，生活要有规律。
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