灵芝孢子粉的副作用一般需要根据具体情况来决定。
例如，对儿童来说，会导致发育问题和过敏。必须注意的是，尤其是儿童的免疫系统还不完善，食用灵芝孢子粉会干扰儿童的正常新陈代谢。其次，对于孕妇，灵芝孢子粉不建议孕妇食用，以免产生强烈的副作用，影响孕妇和胎儿，甚至导致子宫运动加剧，导致流产的风险。第三，严重肝肾两虚的患者常伴有肝硬化或肾功能衰竭。灵芝孢子粉在患者中的使用将导致器官衰竭的加重和生活质量的下降。
灵芝孢子粉的作用和功效包括，第一，灵芝孢子粉的功效之一是保肝解毒，增强肝脏代谢功能，使其能有效代谢药物和毒物，提高其再生能力，显著缓解各类病毒性肝炎、肝硬化和脂肪肝的不良症状，使肝功能尽可能恢复正常。一些乙肝患者服用灵芝孢子粉后可转为阴性。第二，灵芝孢子粉也可用于治疗神经系统疾病。对人体中枢神经系统有理想的调节作用。能稳定和镇静，缓解神经衰弱、失眠、健忘、恐慌、出汗、疲劳等由神经紧张和过度疲劳引起的不良症状。第三，灵芝孢子粉中的有效成分能有效降低血脂，增强血液供氧能力，改善血液循环，尤其是改善脑血循环和外周血循环，最终达到治疗心血管疾病的目标，从而有效缓解头晕症状，因冠心病、高脂血症、动脉硬化等疾病引起的胸闷、气短、记忆力减退。
建议患者服用期间，注意饮食宜清淡，避免辛辣、生冷、油腻刺激性的食物。避免烟酒。
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