抗甲状腺药物最常见的不良反应主要有肝功能受损、白细胞减少、过敏性的皮疹。
1、肝功能受损，抗甲状腺药物可以导致中毒性肝病，其中丙基硫氧嘧啶最容易导致谷丙转氨酶或者谷草转氨酶水平升高，给予抗甲状腺药物后要定期复查肝脏功能，必要时停用抗甲状腺药物，给予保肝药物治疗。2、白细胞减少，如患者在用药以后白细胞出现逐步下降的趋势，应该考虑停药，在用药期间嘱患者要注意出现咽痛、发热要及时就诊，避免出现粒细胞缺乏症。如果白细胞减少可以同时加用升白药物口服，定期复查血常规，如果发展到粒细胞缺乏需要停用抗甲状腺药物治疗，给予促进白细胞生成的药物。3、抗甲状腺药物还可引起过敏性的皮疹，出现皮疹后给予抗过敏药物治疗，皮疹严重时可以停用抗甲状腺药物治疗，患者口服抗甲状腺药物治疗出现严重不良的副作用，应考虑换用碘-131治疗或外科手术治疗。
抗甲状腺药物是比较常见的治疗甲亢的一种药物，适合甲状腺功能亢进症病情较为轻微以及病程较短的患者，还有一些甲亢患者的甲状腺较小，也可以通过使用抗甲状腺的药物来进行治疗。另外，儿童、青少年甲亢患者以及妊娠期甲亢患者，不适合使用放射碘131治疗的患者，也可以通过服用抗甲状腺药物来进行治疗。抗甲状腺药物治疗甲亢的效果是显著的，而且不会使患者出现永久性甲状腺功能减退症，比较经济、安全。
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