角化囊肿通过药物治疗和手术治疗等方法治疗。
角化囊肿通过以下方法治疗：药物治疗：如果角化囊肿伴有感染，术前应使用抗生素或其他抗菌药物控制炎症。抗生素可以是广谱抗生素，如头孢菌素类如头孢丙烯，大环内酯类如红霉素，或厌氧抗生素如甲硝唑。为了防止术后感染的发生，也可以采用常规的抗炎治疗。手术治疗：
1、角化囊肿刮除术，这种手术方式与其他颌骨囊肿相同，可以一次性清理缝合。
2、口外刮除术，对于下颌角或下颌升支处的囊肿，甚至该处较大的囊肿，应采用口外入路切除，方便暴露视野，使术者直接看到，再行囊肿刮除术。
如果不能完全刮除，可酌情切除部分骨头。
3、颌骨节段切除术，当角化囊肿病变较大，穿透颌骨并侵犯周围组织时，或病变已累及颌骨并引起颌骨骨折时，除了行角化囊肿刮除术外，还可行颌骨节段切除术。
这种手术的意义在于根治病变，避免复发。
4、上颌窦根治术，当角化囊肿范围较广，累及上颌窦，或上颌窦本身有炎症时，可同时行上颌窦根治术。
内切口缝合严密时，应在骨腔内填塞碘仿纱条充分引流，下鼻道开窗引流。一般手术后3~5天医生就可以把纱布取出来了。该手术的意义在于受累面积较大，连同累及上颌窦应一并切除。
角化囊肿需要注意的是：首先平时不要吃刺激性食物，尤其是辛辣油腻的食物，减少对口腔的刺激。建议多吃新鲜的蔬菜水果，避免吃变质的食物，可以有效防止复发的可能。其次保持充足的睡眠，不要熬夜，防止过度疲劳。在睡眠中，人的精神也能得到休息和恢复，使人的精神生理处于良好的状态，有利于增强免疫力，可以防止复发。最后注意口腔卫生，早晚刷牙，定时洗牙，饭后用淡盐水漱口，保持口腔清洁，可减少复发。
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