MALT淋巴瘤一般通过放疗、化疗等方法进行治疗。
MALT淋巴瘤最常发生的部位是胃，胃原发MALT淋巴瘤与幽门螺杆菌的感染相关，所以抗幽门螺杆菌治疗可以使2/3的局限期胃MALT淋巴瘤达到完全的缓解。但是远期复发是需要注意的问题，所以应该长期随访。对于局限期的胃MALT淋巴瘤抗幽门螺杆菌治疗无效或者有效后复发者，可以行胃及周围淋巴结放疗，可以达到治愈的效果，并且能够保留胃的功能。局部放疗失败后的患者，可以考虑全身化疗，或者加上利妥昔单抗靶向治疗。如果上述治疗均无效果，局限期患者应该选择外科手术切除。晚期的患者临床并不常见，治疗原则与滤泡淋巴瘤相似，一般采用化疗，特殊情况下可以考虑局部放疗。
MALT淋巴瘤可发生在眼眶、肠、肺、膀胱、肾脏和中枢神经系统，有时表现为常规影像学检查发现的新生儿肿块，或一些局部症状。如胃淋巴瘤的上腹部不适，约40%的患者累及淋巴结和邻近器官。也可能发生远处转移，尤其是在转化为弥漫性大B细胞淋巴瘤后。许多发展为这种淋巴瘤的患者有自身免疫或炎症过程，如干燥综合征、桥本甲状腺炎或幽门螺杆菌性胃炎。
MALT淋巴瘤患者的饮食应清淡易消化，主要是高热量、高蛋白和富含维生素的食物，比如谷物、豆类、蔬菜和水果。患者可以在日常生活中饮用适量的水，这有利于促进体内代谢废物的排出。注意食物卫生，饭前洗手饭后漱口，可以用软牙刷清洁口腔。
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