菌血症和败血症的区别主要在于菌血症血液中存在的活菌，这些病原菌不会繁殖或者很少繁殖，很快就会被机体的防御系统所清除，不会引起或者只引起轻微的炎症反应。脓毒血症是由于病原菌侵入到血液循环当中，在血液中生长繁殖。
败血症与脓毒症不同。原因在于败血症的泛发性疾病包括败血症的不良症状，而脓毒血症只是败血症的多种类型之一。败血症可分为菌血症和脓毒血症，如果患者血液中有细菌感染，会导致患者血液中大量生长繁殖。如果患者的身体免疫力足够强，此时可以借助身体的免疫力来控制甚至消灭细菌。这种情况称为菌血症。如果患者免疫系统低下，血液中的细菌无法清除，则容易诱发全身不良症状，出血明显，包括一些多发性脓肿，即为败血症。脓毒血症是败血症中较为严重的病症。脓毒症是一种比较严重的疾病，是一种全身感染性疾病，通常是因为患者感染了病原菌，病原菌的毒素侵入患者的血液循环系统，进而诱发一系列临床不良症状 。该病的发生多为急性起病，会引起一些症状，如高烧、寒战，以及皮肤上的瘀点和瘀斑。患者病情严重，甚至会导致患者休克。脓毒症的出现通常具有脓毒症的所有不良症状。同时，还可能引起患者全身各器官化脓，诱发肝脓肿、肾脓肿等不良症状。
如果病原菌和机体的免疫防御系统之间失去平衡，病原菌就会在血液系统中持续存在并且繁殖，产生大量毒素，在体内产生大量炎性介质，引起机体出现一系列脓毒血症的感染症状，主要表现为高热、寒战、呼吸急促、心率加快、皮疹、皮肤的瘀点或瘀斑、淋巴结以及肝或脾肿大，白细胞计数明显升高等。
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