新生儿水、便分离通常是腹部着凉、胃肠功能障碍、病毒感染、消化不良、肠炎等引起。
1、腹部着凉：
出生的新生儿更敏感，容易因冷刺激而引起不适。如果新生儿的腹部着凉，新生儿的肠胃会剧烈收缩，从而引起腹泻症状。这种腹泻症状在腹部保暖后可以有效缓解。由腹部着凉引起的腹泻一般不需要特殊治疗。
2、胃肠功能障碍：
当新生儿的肠道益生菌减少，肠道菌群异常时，就会发生胃肠功能障碍。当肠道功能障碍时，很容易引起严重腹泻。这种情况与新生儿不规律的休息、不健康的饮食等有关。
3、病毒感染：
如果新生儿不小心吃了不干净的食物，细菌和病毒可能会感染胃肠道，导致急性肠道炎症。病毒感染引起的腹泻通常会导致新生儿哭泣，但有些新生儿会变得非常安静，变得越来越虚弱，这些新生儿会出现严重的腹泻症状。如果是病毒感染，需要及时治疗，否则很容易脱水。
4、消化不良：
消化不良是指持续或反复出现的上腹部不适。还可以包括餐后饱腹、腹胀、打嗝、呕吐以及腹泻等。消化不良是由多种疾病形成的综合征，根据其病因可分为器质性和功能性两类。
5、肠炎：
肠炎是由多种原因引起的肠道炎症反应。如肠道细菌、病毒等致病性维生素感染或免疫损伤、辐射损伤、饮食刺激、药物刺激等因素。主要临床表现为发热、呕吐、腹痛、腹泻以及水样大便等，部分患者还可能有严重的急迫感。根据病因不同，肠炎可分为感染性和非感染性。根据病程长短，可分为急性肠炎和慢性肠炎。严重的肠炎可导致脱水和电解质紊乱，甚至危及生命。
肠炎患者需要注意不要喝牛奶或吃大量的糖，容易发酵并产生大量气体，导致腹痛。牛奶含有更多的脂肪，可以润滑肠道，增加肠道蠕动，增加肠道负担，加剧腹泻。
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