脑脊液检查主要是检查脑脊液的性状、细胞数、蛋白质含量、糖含量、氯化物含量，以及细胞学、病原学、免疫球蛋白含量、蛋白质电泳等方面。
检查结果的分析对疾病尤其是中枢神经系统疾病的诊断具有重要意义。不同疾病脑脊液的特点和化学成分是不同的，脑脊液成分的检测也可以为疗效评估和预后判断提供参考。
细菌性脑膜炎、结核性脑膜炎、隐球菌性脑膜炎、病毒性脑膜炎、神经梅毒等中枢神经系统感染性疾病需要进行脑脊液检查。脑梗死、脑出血、脑积水、蛛网膜下腔出血、椎旁脓肿等疾病。
除此之外，还有多发性硬化症、重症肌无力、脑瘤，尤其是恶性肿瘤、脊髓灰质炎、脑寄生虫。
脑脊液的检查对神经内科来说是非常重要的。如果患者出现发热、头疼、意识障碍，出现认知功能障碍或者是精神行为异常，都建议进行腰椎穿刺检查化验脑脊液，主要目的是明确有没有中枢神经系统感染以及是哪种类型的感染的。
如果患者出现肢体的麻木无力，出现尿便障碍，颅脑磁共振、脊髓磁共振提示有脱髓鞘病变也是要检查脑脊液的。
如果患者忽然出现了周围神经疾病的表现，比如出现了四肢的无力、感觉障碍也是要检查脑脊液，目的是明确有没有格林巴利综合征。
脑脊液检查要注意不要太紧张。腰椎穿刺的压力大多是增加的。有些肿瘤，如位于脑表面或脑室内的肿瘤，可使脑脊液蛋白含量增加，白细胞增多，有的可以见到肿瘤细胞。
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