三联疫苗和五联疫苗的区别在于，包含的疫苗种类数量、注射时间、免疫时间长短等方面。
1、包含的疫苗种类数量
三联疫苗指的是百日咳、白喉、破伤风疫苗，五联疫苗指的是B型流感嗜血杆菌疫苗、无细胞流感疫苗，通常采取三种疫苗进行基础免疫，再加强免疫。
2、注射时间
三联疫苗注射时间是在出生后3个月、4个月和5个月时各接种一剂，而五联疫苗的注射时间是在出生后2个月、4个月和6个月时各接种一剂。
3、免疫时间长短
三联疫苗免疫时间比较长，一般可以维持15年左右，五联疫苗免疫时间相对较短，一般可以维持5年左右。
此外，三联疫苗和五联疫苗在接种后可能会出现不良反应，比如发热、腹泻、皮疹等，如果没有明显不适症状，一般不需要特殊治疗，注意观察即可。如果出现发热、腹泻等症状，要及时到医院就诊治疗。
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