脐尿管囊肿可以使用药物治疗和手术治疗。
临床上主要的治疗方法为手术切除囊肿，如并发有炎症应先行切开引流，待炎症消退后再行切除。手术时尽量避免切开腹膜，以免发生腹膜炎。对于继发感染的患者，医生可给予其青霉素等药物来控制感染。对于有疼痛不适的患者，医生可给予其对乙酰氨基酚等药物来达到解热、镇痛、消炎的目的。由于残留的脐尿管任何部分均可能发生癌变，且脐尿管疾病恶变几率较高，因此脐尿管疾病一旦确诊，均应早期手术治疗。术中医生会尽可能彻底切除脐尿管和周围病变组织，同时注意保持腹膜完整，以避免造成腹腔污染，合并感染与腹膜有粘连时，可连同粘连的腹膜一起切除。临床上医生一般会争取保留患者的脐孔。常用的方法有传统开腹手术、腹腔镜下手术。脐尿管是脐与膀胱之间疏松结缔组织内的一条纤维索，一般在胚胎晚期，脐尿管会全部闭锁，退化为脐正中韧带。若出生后脐尿管不闭合，即形成先天性异常。若脐尿管两端闭锁，仅中段管腔残存，则形成脐尿管囊肿。脐尿管囊肿的主要临床表现为在下腹部正中表浅位置有一囊性包块。部分患者可有腹痛的表现。
患者术后需观察伤口有无渗血、渗液，有无红、肿、热、痛等表现，若存在需及时报告给医生。在术后24小时内应减少活动，以防止伤口开裂及伤口感染，若出现异常情况应及时告知医生，切不可自行处理。患者需要多休息，避免剧烈运动。
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