查不出病因的腹痛可以根据经验给予缓解胃肠痉挛的药物以及止痛的药物来治疗，还可以借助中医针灸的方法，如果腹痛剧烈还可能需要手术来治疗。
腹痛一般是肝胆疾病或者是消化系统的疾病引起，如果经过血常规，腹部CT，腹部核磁等各方面的检查，查不出具体原因，一般考虑是胃肠道痉挛引起的，可以给予抗痉挛的药物以及止痛的药物。对于不明原因的腹痛，中医针灸针刺天枢，中脘等穴位，也有缓解症状的作用。如果疼痛剧烈又查不出具体原因，就有必要进行开腹探查手术来检查和治疗。
首先会引起急性胃肠炎：腹痛以上腹部与脐周部为主，常呈持续性急痛伴阵发性加剧。常伴恶心、呕吐、腹泻，亦可有发热。体格检查时可发现上腹部或及脐周部有压痛，多无肌紧张，更无反跳痛，肠鸣音稍亢进。结合发病前可有不洁饮食史不难诊断。其次胃、十二指肠溃疡：好发于中青年，腹痛以中上腹部为主，大多为持续性腹痛，多在空腹时发作，进食或服制酸剂可以缓解为其特点。体格检查可有中上腹压痛，但无肌紧张亦无反跳痛。频繁发作时可伴粪便凝血试验阳性。胃肠钡餐检查或内镜检查可以确立诊断。再者肠梗阻：见于各种年龄的患者，儿童以蛔虫症、肠套叠等引起的为多。成年患者以疝或肠粘连引起的多，老年则可由结肠癌等引起。肠梗阻的疼痛多在脐周，呈阵发性绞痛，伴呕吐与停止排便排气。体征检查时可见肠型、腹部压痛明显，肠鸣音亢进，甚至可闻气水声。如若腹痛呈持续性疼痛伴阵发性加剧，腹部压痛明显伴肌紧张及反跳痛，或发生腹水，并迅速出现休克者则提示为绞窄性肠梗阻。Ｘ线平片检查，若发现肠腔充气，并有多数液平时肠梗阻的诊断即可确立。
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