对于真菌孢子皮肤病的治疗来说，可以根据患者的病情进行对症治疗。
真菌的主要生殖器官，可分为有性孢子和无性孢子，前者是由两个细胞融合和基因组交换形成的，后者是由菌丝体分裂形成的，没有这个阶段。孢子在适宜条件下萌发，形成菌丝，分裂繁殖；当外部环境不适合时，可以休眠并存活很长时间。如果患者感染部位在皮肤，就是皮肤真菌感染，一般可通过外用抗真菌药物治疗，如酮康唑软膏、联苯苄唑软膏外涂，并保持局部皮肤的干燥。如果是阴道白带检出真菌孢子，考虑霉菌性阴道炎，阴道使用克霉唑阴道栓，每天清洗内裤，阳光暴晒，注意卫生，提高免疫力。如果是肺部或者血液当中检出真菌孢子，可行痰涂片、痰培养或者血培养进一步明确感染的是何种真菌孢子，根据药敏试验选择针对性的抗真菌药治疗，疗程要足，以免复发。
真菌孢子皮肤病患者需要注意：首先，一些抗病毒药物可以口服治疗真菌性皮肤病，抗病毒药物对真菌性皮肤病有很好的治疗效果，这种药物还可以缓解真菌性皮肤病的一些并发症，然而患者应特别注意，当再次使用某些抗病毒药物时，在医生的指导下使用，以避免药物刺激和其他并发症，只有经常更换衣服，患者才能养成贴近皮肤的良好习惯，更加关注日常生活。其次，平时洗澡时不要用过热或过冷水。过热或过冷的水会在一定程度上刺激皮肤。特别是，过热的水可以增强细胞的渗透性，使真菌容易引起身体其他部位，并使疾病更加严重。清洁皮肤时，不要用硬而锋利的物体因外界影响而划伤皮肤，进一步对受影响的部位造成损害，使疾病更加严重。此外，养成良好的生活习惯，少吃辛辣食物，这些辛辣的东西会刺激身体出汗，导致皮肤表面过多油腻。
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