慢性肾萎缩的治疗主要是通过对慢性肾脏疾病的综合治疗来延缓疾病的进展。肾萎缩的常见病因包括慢性肾炎、高血压性肾损害、缺血性肾病等，有必要通过肾功能、尿常规等相关检查全面了解病情。如果肾萎缩已发展为尿毒症，则需要在治疗方面开始透析治疗，如血液透析和腹膜透析。在治疗过程中，注意定期随访和复查，监测病情变化。
如果患者出现慢性肾萎缩，则取决于肌酐水平。肌酐不是很高，仍然需要控制患者的并发症，即早期控制血压和血糖，纠正肾性贫血和高血压。如果萎缩的肾脏无法恢复，只能推迟其进入透析。如果患者两侧肾脏很小，肌酐很高，肾小球滤过率低于15，且患者有明显症状，仍建议该患者进行肾脏替代治疗，而不是依赖一些药物来降低肌酐。如果出现双侧肾萎缩，则表明肾功能下降，饮食中应谨慎，首先，应限制蛋白质的摄入，蛋白质的最佳摄入量是优质蛋白质，如鸡蛋清、瘦肉、鸡肉和鱼肉，这些蛋白质容易被人体吸收；还需要限制盐的摄入。两个肾脏都缩小了，肾功能降低了，出现了水潴留，电解质也受到了干扰。因此，患者可能会出现水肿和高血压。每天的食盐摄入量应减少；患者应少吃含钾量高的水果和蔬菜，如菠萝、芒果和香蕉，这些水果含有高钾离子，进食后不易被人体代谢或由肾脏排泄。
患者尽量不吃辛辣、油腻、烧烤等食物，这些食物容易产生大量代谢废物，增加肾脏负担。患者在日常生活中，注意预防感冒，不要熬夜和过度工作。在饮食上，注意低盐、低脂、优质、低蛋白的原则，减轻肾脏负担。
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