试管婴儿男子通常通过手淫的方式取精。
护士会要求男子洗手，取一个干净的精子杯，去一个安静温暖的房间，通过手淫取出精液。对于少数在精子提取方面有困难的人，可能必须提前取出精子，并在卵子提取当天将其冷冻以供使用。对于极少数有困难的人，也可以使用按摩器帮助取出精液。对于生精障碍或精子稀少的人，也可以通过切割睾丸或附睾来获取精子。因此，体外受精的丈夫有三种取精子的方法：常规手淫、在按摩师的帮助下取精子、以及手术切除附睾或睾丸取精子。
对于那些精子提取困难的患者，可以在男性医生的心理指导和药物干预下进行精子提取。如果这些方法仍然无效，可以进行经皮附睾和睾丸精子提取。当无精子症患者是试管婴儿时，可以使用附睾和睾丸精子提取或睾丸微精子提取。手术取精的目的是获得足够数量的精子进行胞浆内精子显微注射，即进行第二代体外受精，从而获得较高的受精率，达到怀孕的目的。如果显微精子提取失败，只能成为精子库中精子的试管婴儿。还有一种可能性是，收集精子有困难的男子也可以提前冷冻精子。有些人可以在收集卵子的那天手淫并顺利取出精液，因为很放松。
当男子射精困难或无精子症、严重少精子症和弱精子症时，不再通过手淫从睾丸取出精子，而是通过手术。如因男方原因、女方原因或不明原因反复失孕，可进行体外受精。当男子精液质量正常且射精功能正常时，首选手淫的方法提取精液并从精液中分离精子。其优点是简单、无创、易于重复。如果患者因性功能障碍无法射精，或患有生殖疾病，导致射精中出现严重的少精子症、弱精子症或无精子症等疾病，则不能通过手淫取出精液，但需要通过手术取出。
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