脓肿的治疗方法有切开引流、穿刺引流、其他治疗等方式。
1、切开引流：切开引流是外科最原始或最初的治疗方式，能够将脓液引流到体外，随着脓液的引出，炎症可逐渐消退，组织开始生长直到愈合。以前无论是表面脓肿还是腹部脓肿，均需要进行切开引流，例如阑尾周围脓肿、膈下脓肿、盆腔脓肿、体表脓肿等。脓肿切开术通常采用周围浸润麻醉的方式，相对较大的脓肿可行全麻。由外周向中心消毒，因为脓肿伤口属于被污染伤口。为方便引流，切开时切口方向避免与身体纵轴方向垂直，切口避免过长，同时切口深度需要达到脓肿深面，部分脓肿呈多房性，切开时需要打开间隔。切开后局部出血如果较多，可采用填塞压迫的方式止血。针对术后早期出血，可使用油砂压迫，24小时后取出油砂，使用盐水纱条引流。脓肿切开术为临床上较常用的手术方式，已形成脓肿的疾病需要行切开引流治疗。
2、穿刺引流：随着现代介入医学的发展，对于腹部深部脓肿，例如膈下脓肿、盆腔脓肿、阑尾周围脓肿，不建议进行切开引流，因为对患者的影响比较大。此时对于脓肿的主要措施是引流，可以通过超声或CT引导下穿刺、放置引流管，也可以较好地消除或治疗脓肿，多数情况下可以得到比较满意的治疗效果。但如果引流不畅或无法穿刺，则只能选择切开引流。
3、其他治疗：对于脓肿引流只是局部治疗，如果脓肿比较大并且有全身中毒、感染症状，患者还应口服或静脉使用抗生素，有助于炎症控制、脓肿引流与吸收。
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