新生儿小耳畸形可能是环境因素、心理原因、孕产妇疾病等原因引起的。
1、环境因素：主要的环境因素是，当母亲处于怀孕早期，如果患有病毒性感冒、空气污染、使用杀虫剂或者生活在有毒环境中，可能会诱发新生儿小耳朵畸形。
2、心理原因：一些女性在怀孕时压力很大，尤其是在一些父权制家庭，这可能会带来更大的意识形态负担。担心家人会不喜欢女孩，当然，有些人担心生孩子是不正常的，这些过度的心理压力也可能导致新生儿小耳朵畸形的发生。
3、孕产妇疾病：母亲在怀孕期间可能会遇到一些流感，当然，也可能有带状疱疹病毒感染。怀孕时，如果有妇科炎症、多胎妊娠、胎盘早剥或前置胎盘，发生小耳畸形的概率会相对较高。
新生儿小耳畸形是出生时的一种耳廓畸形，主要是由于胚胎期第一、二鳃弓发育异常所致。一般情况下，耳廓会出现严重发育不良，没有正常的耳廓征形态，耳区仅可见挛缩、变形的小软骨块和异位耳垂。常伴有外耳道闭锁或缺失，目前，关于新生儿畸形是否是遗传性的原因，尚无定论。根据不同文献报道的新生儿小耳畸形家族史，家族发病率约为3%~30%。目前已有相关文献报道，但尚未发现与新生儿小耳畸形相关的容易传染基因。目前，关于新生儿小耳畸形的家族史尚无定论，也不认为新生儿畸形与遗传因素有关。由于耳廓筛查尚未纳入产前检查，因此没有有效的新生儿小耳畸形产前检测。
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