复杂性尿路感染病原菌，很多是大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌等。
对于复杂性尿路感染，建议要做血培养、尿培养，这样可以找到有什么细菌存在，选择敏感的抗生素进行治疗。复杂性尿路感染要有效地使用抗生素，才可以达到好的治疗效果。使用抗生素不当，容易出现耐药性加快，导致病情进一步地加重。使用抗生素的期间应该多喝水，注意引流管道的通畅，才可以早期控制感染、恢复疾病。复杂性尿路感染典型症状有膀胱炎，占尿路感染的60%以上，分为急性单纯性膀胱炎和复发性膀胱炎。急性肾盂肾炎，患者发病急，临床表现与感染程度有关，可以发生在所有年龄组，最常见的是育龄妇女，尿频、尿急、疼痛、排尿困难等，部分患者的泌尿系统症状不典型且明显。慢性肾盂肾炎，患者临床表现复杂，全身及泌尿系统局部表现不典型，超过一半的患者可能有急性肾盂肾炎病史，可能伴有不同程度的低热、间歇性尿频、尿路不适和腰痛，肾小管功能受损，如夜尿症增多、尿比重降低等，一些患者的病情持续恶化，并可能发展为慢性肾功能衰竭。
复杂性尿路感染应注意以下事项。家属应为患者提供卫生舒适的生活环境。确保患者充足的睡眠和增强免疫力。注意个人卫生，养成良好的卫生习惯，勤洗手、勤洗澡，尤其是饭前和大便后。每天用温水清洗外阴，穿棉质或丝绸内衣，经常更换和清洗内衣，不要与别人共用毛巾、浴巾等个人物品。养成良好的生活习惯，避免憋尿。
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