CT可以查出很大一部分肠道问题。CT具有检查速度快，可重建、可重复性强的优势，目前已广泛应用于肠道病变的检查当中，主要有三种方式。第一种是CT平扫，可以观察肠道的形态，密度等。第二种口服对比剂后的平扫，口服对比可以更清晰地显示肠道的走形和肠壁的状态。第三种为CT增强检查，可以通过强化情况，对病变进行定位、定性、定量分析，还可以观察病变，周围的形态及情况，但确实也存在一些局限性，比如对于一些小的病灶检出率并不高，如息肉。
腹部的增强CT可以初步地判断肠道的一些肿瘤性病变，尤其是肿瘤超过2cm时，可以初步判断其形态、位置，以及良恶性。此外，小肠CT可以比较准确判断小肠是否存在节段性病变、肿瘤，或者是否有狭窄、梗阻的情况。小肠CT是指喝泻药清肠之后，然后再次喝一定量的液体将小肠充盈，进行CT扫描之后，然后将扫描的图片重构，来判断小肠的走向形态以及是否存在病变的情况，可以初步判断小肠以及结肠的病变情况。如果CT发现有肠道的病变，可以进一步做结肠镜或者小肠镜来明确该部位病变情况，是作为小肠镜检查之前初步筛查肠道疾病的检查方法。
肠镜是一种内窥镜，既可以作为一种检查方式，判断肠道内有没有息肉，溃疡以及肿瘤现象，也可以在肠镜下通过电切手术将息肉，肿瘤切除，因此也可以算是一种治疗方式。做肠镜检查有时间限制，一般需要预约，需要做好肠道准备，一般在做检查前两天，需要选择使用泻药来促进肠道排空。
按疾病找