咽肌麻痹需要查明病因，并进行对症治疗。
咽肌麻痹在临床上可分为中枢性麻痹和周围性麻痹，中枢性麻痹是由于多种病因所导致的延髓病变，在临床上常见于局部的病毒、细菌感染、肿瘤压迫以及创伤，经常见于脑炎或者听神经瘤。而周围性麻痹多是由于多发性神经炎发作，或者局部的炎症感染，所引起的咽喉部症状，患者会出现咽喉部的不适感，以吞咽不适最为严重，同时还会出现咽喉异物感以及开放性鼻音、鼻腔食物反流等。患者需要到医院检查电子鼻镜可以确诊，在检查时可发现软腭不能上举，双侧软腭不对称。如患者为中枢神经系统异常，需要神经科和内科治疗，病因治疗的同时也要注意针对患者局部症状的处理。对于周围性麻痹者，需应用改善微循环药物，如抗胆碱酯酶药或神经兴奋剂、维生素类等药物进行治疗，还可进行电刺激疗法和针刺疗法。若患者出现咽缩肌瘫痪不能进食或有误吸的情况，应进行鼻饲饮食。另外，由于疾病的痛苦以及大量的辅助检查会给患者带来沉重的心理压力，患者可能会产生焦虑、急躁等不良情绪。因此家属可多安慰与陪伴患者，使患者积极配合治疗。
患者要注意咽部分泌物的排出，应按医嘱用药，积极治疗原发病，病情出现反复应及时就医。还应注意休息，保证足够的睡眠，避免熬夜。不可以进行剧烈运动，避免情绪激动。应做到戒烟戒酒，减少酒精和香烟的刺激，以免病情加重。
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